ウイルスと抗体の研究はどうやってる？【番外編 ウイルス学】#24
今回はレンのもう一つの番組SciEnTALK / サイエントーク Ep34, 35からの再編集版エピソードになっています。 研究者レンのもう１つの番組 SciEnTALK/サイエントークはこちらから→ https://lit.link/scientalk この番組がまだ構想段階の時にお話ししたウイルスと学生コミュニティのお話です。 【ゲスト】 矢藤慶悟さん 学生コミュニティBEAST共同代表, 東京理科大D3, 国立感染研 「日本の若き"研究者"が社会実装に挑戦する文化を作る」 BEASTのHPはこちら BEAST主催のピッチコンテスト「GENSEKI」詳細は↓から https://www.notion.so/GENSEKI-46ac77cff54a4197a53fb348a776fd4a 矢藤さんの論文 Identification of two critical neutralizing epitopes in the receptor binding domain of hepatitis B virus preS1 Journal of Virology, 95, e01680-20, 2021 論文の記事はこちら B型肝炎ウイルス(HBV) エピトープ：ウイルスなどの抗原には、相補的な抗体が特異的に結合する小さな部位があり、これをエピトープまたは抗原決定基と呼びます。 抗原分子は三次元の立体構造を持つため、抗体によって認識されるエピトープは、抗原の特定の立体構造に依存している。 抗原のどこを狙った抗体を作ればいいのかを考える際に重要。 ヒト免疫不全ウイルス（HIV） HBVの表面タンパク質 ナトリウムタウロコール酸共輸送体（NTCP）：HBVは宿主側受容体であるナトリウムタウロコール酸共輸送体（NTCP）と結合することで標的細胞へ吸着する。 ポリクローナル抗体とモノクローナル抗体 リコンビナントタンパク質 プラスミドDNA インビトロ：“試験管内で（の）”という意味で、試験管や培養器などの中でヒトや動物の組織を用いて、体内と同様の環境を人工的に作り、薬物の反応を検出する試験のこと 質問、感想、ゲスト出演の問い合わせなどは以下Twitter・お便りフォームまでお願いします。 Twitter ＃サイエンマニア https://twitter.com/REN_SciEnTALK おたよりフォーム https://forms.gle/H4vg7MuN77VqbHV79 1シーズン1人のゲスト形式で、各エピソードは一区切りのチャプターとしてご利用いただけます。 流し聞きする場合は、エピソードを古い順に並べ替えていただくとシームレスに聞くことができます。 BGM Future Sky/ SAKURA BEATZ.JP Somehow/Khaim https://www.khaimmusic.com/
雑草で暮らしを豊かに。【道草を食むコラボ 雑草④】#23
食べる以外にも雑草のインテリアやおすすめの雑草などを語っていただきました。 ゲスト Michikusaさん Twitter: https://twitter.com/tampopopon9 Instagram: https://www.instagram.com/wildflower_michikusa/ #農系ポッドキャスト 【道草を食む】 Apple podcast: https://podcasts.apple.com/jp/podcast/%E9%81%93%E8%8D%89%E3%82%92%E9%A3%9F%E3%82%80/id1568321756 Spotify: https://open.spotify.com/show/7EggD0VWqAORYAGAVKL2Ay?si=135275858afc4db1 【雑草RADIO】 Apple podcast: https://podcasts.apple.com/jp/podcast/%E9%9B%91%E8%8D%89radio/id1567753162 Spotify: https://open.spotify.com/show/1dZepIefDyvg2yuqrDhGEb?si=97beeea07cb641ea ▶雑草のインテリア ぜひMichikusaさんのInstagramをチェック！→ https://www.instagram.com/wildflower_michikusa/ ▶おすすめの雑草 センダングサ：関東地方以西〜九州の道ばたや河原などに生えているそう。花期は9〜10月 質問、感想、ゲスト出演の問い合わせなどは以下Twitter・お便りフォームまでお願いします。 Twitter ＃サイエンマニア https://twitter.com/REN_SciEnTALK 研究者レンのもう１つの番組 SciEnTALK/サイエントークはこちら→ https://lit.link/scientalk おたよりフォーム https://forms.gle/H4vg7MuN77VqbHV79 1シーズン1人のゲスト形式で、各エピソードは一区切りのチャプターとしてご利用いただけます。 流し聞きする場合は、エピソードを古い順に並べ替えていただくとシームレスに聞くことができます。 BGM Future Sky/ SAKURA BEATZ.JP Somehow/Khaim https://www.khaimmusic.com/
雑草にハマったメリットとデメリット【道草を食むコラボ 雑草③】#22
雑草を食べることの楽しさや、夢中になりすぎて少し困ったことなどを語っていただきました。 ゲスト Michikusaさん Twitter: https://twitter.com/tampopopon9 Instagram: https://www.instagram.com/wildflower_michikusa/ #農系ポッドキャスト 【道草を食む】 Apple podcast: https://podcasts.apple.com/jp/podcast/%E9%81%93%E8%8D%89%E3%82%92%E9%A3%9F%E3%82%80/id1568321756 Spotify: https://open.spotify.com/show/7EggD0VWqAORYAGAVKL2Ay?si=135275858afc4db1 【雑草RADIO】 Apple podcast: https://podcasts.apple.com/jp/podcast/%E9%9B%91%E8%8D%89radio/id1567753162 Spotify: https://open.spotify.com/show/1dZepIefDyvg2yuqrDhGEb?si=97beeea07cb641ea ▶タラの芽 ▶コシアブラ ▶ヨウシュヤマゴボウ ▶チョウセンアサガオ：ヒヨスチアミンとスコポラミン ▶キョウチクトウ ▶雑草さがし ▶農家の方とのつながり 質問、感想、ゲスト出演の問い合わせなどは以下Twitter・お便りフォームまでお願いします。 Twitter ＃サイエンマニア https://twitter.com/REN_SciEnTALK 研究者レンのもう１つの番組 SciEnTALK/サイエントークはこちら→ https://lit.link/scientalk おたよりフォーム https://forms.gle/H4vg7MuN77VqbHV79 1シーズン1人のゲスト形式で、各エピソードは一区切りのチャプターとしてご利用いただけます。 流し聞きする場合は、エピソードを古い順に並べ替えていただくとシームレスに聞くことができます。 BGM Future Sky/ SAKURA BEATZ.JP Somehow/Khaim https://www.khaimmusic.com/
雑草たちの生存戦略【道草を食むコラボ 雑草②】#21
雑草たちの個性豊かな生存戦略について語っていただきました。 ゲスト Michikusaさん Twitter: https://twitter.com/tampopopon9 Instagram: https://www.instagram.com/wildflower_michikusa/ #農系ポッドキャスト 【道草を食む】 Apple podcast: https://podcasts.apple.com/jp/podcast/%E9%81%93%E8%8D%89%E3%82%92%E9%A3%9F%E3%82%80/id1568321756 Spotify: https://open.spotify.com/show/7EggD0VWqAORYAGAVKL2Ay?si=135275858afc4db1 【雑草RADIO】 Apple podcast: https://podcasts.apple.com/jp/podcast/%E9%9B%91%E8%8D%89radio/id1567753162 Spotify: https://open.spotify.com/show/1dZepIefDyvg2yuqrDhGEb?si=97beeea07cb641ea ▶セイタカアワダチソウ ▶アレロパシー ▶ドクダミ ▶分子の戦争 ▶植物のライフサイクル ▶樹齢6000年のバオバブの木 https://tabicoffret.com/article/74634/index.html ▶スズメノカタビラ ▶「雑草という名の草はない」 質問、感想、ゲスト出演の問い合わせなどは以下Twitter・お便りフォームまでお願いします。 Twitter ＃サイエンマニア https://twitter.com/REN_SciEnTALK 研究者レンのもう１つの番組 SciEnTALK/サイエントークはこちら→ https://lit.link/scientalk おたよりフォーム https://forms.gle/H4vg7MuN77VqbHV79 1シーズン1人のゲスト形式で、各エピソードは一区切りのチャプターとしてご利用いただけます。 流し聞きする場合は、エピソードを古い順に並べ替えていただくとシームレスに聞くことができます。 BGM Future Sky/ SAKURA BEATZ.JP Somehow/Khaim https://www.khaimmusic.com/
雑草を食べる？身近な雑草たちの魅力【道草を食むコラボ 雑草①】#20
シーズン6はMichikusaさんとお送りする「雑草の世界」 周りの景色の見方がきっと変わります。 ゲスト Michikusaさん Twitter: https://twitter.com/tampopopon9 Instagram: https://www.instagram.com/wildflower_michikusa/ #農系ポッドキャスト 【道草を食む】 Apple podcast: https://podcasts.apple.com/jp/podcast/%E9%81%93%E8%8D%89%E3%82%92%E9%A3%9F%E3%82%80/id1568321756 Spotify: https://open.spotify.com/show/7EggD0VWqAORYAGAVKL2Ay?si=135275858afc4db1 【雑草RADIO】 Apple podcast: https://podcasts.apple.com/jp/podcast/%E9%9B%91%E8%8D%89radio/id1567753162 Spotify: https://open.spotify.com/show/1dZepIefDyvg2yuqrDhGEb?si=97beeea07cb641ea ▶雑草に興味を持ったきっかけ ▶雑草魂 ▶七草がゆ：セリ、ナズナ、ゴギョウ、ハコベラ、ホトケノザ、スズナ、スズシロ ▶「野菜」と「野草」 ▶オオバコ ▶スミレ ▶エライオソーム ▶閉鎖花 質問、感想、ゲスト出演の問い合わせなどは以下Twitter・お便りフォームまでお願いします。 Twitter ＃サイエンマニア https://twitter.com/REN_SciEnTALK 研究者レンのもう１つの番組 SciEnTALK/サイエントークはこちら→ https://lit.link/scientalk おたよりフォーム https://forms.gle/H4vg7MuN77VqbHV79 1シーズン1人のゲスト形式で、各エピソードは一区切りのチャプターとしてご利用いただけます。 流し聞きする場合は、エピソードを古い順に並べ替えていただくとシームレスに聞くことができます。 BGM Future Sky/ SAKURA BEATZ.JP Somehow/Khaim https://www.khaimmusic.com/
研究者やエンジニアの就職活動と博士進学【海洋微生物③】#19
研究者やエンジニアの就職活動のリアル、日本の大学院や博士進学について語っていただきました。 株式会社tayoに今後も注目です！ 【ゲスト】熊谷洋平さん 株式会社tayo代表取締役 海洋微生物学の環境学博士 Twitter: https://twitter.com/kmoooooog 株式会社tayo: https://tayo.jp/recruitments/student ▶JAMSTEC：海洋研究開発機構、文部科学省所管の国立研究開発法人。既存の調査船や潜水船などに加え、2004年の独立行政法人化の際に東京大学海洋研究所から移管された調査船を用いて、海洋、大陸棚、深海などを観測研究している。 ▶熊谷さんの自己紹介記事 https://magazine.tayo.jp/2021/07/04/%e7%86%8a%e8%b0%b7%e3%80%81%e7%a0%94%e7%a9%b6%e8%80%85%e3%82%84%e3%82%81%e3%82%8b%e3%81%a3%e3%81%a6%e3%82%88/ ▶バイオインフォマティクス：生命科学と情報科学の融合分野のひとつ。DNAやタンパク質をはじめとする生命が持つ様々な「情報」を対象に、情報科学や統計学などのアルゴリズムを用いた方法論やソフトウェアを用いた分析から生命現象を解き明かしていく学問分野。 ▶辺境キャンパス座談会 https://magazine.tayo.jp/2021/08/24/%e8%be%ba%e5%a2%83%e3%82%ad%e3%83%a3%e3%83%b3%e3%83%91%e3%82%b9%e5%ba%a7%e8%ab%87%e4%bc%9a%e3%80%8c%e6%b5%b7%e7%b7%a8%e3%80%8d%ef%bc%9a%e8%be%ba%e5%a2%83%e3%81%a7%e9%80%81%e3%82%8b%e5%a4%a7%e5%ad%a6/ 質問、感想、ゲスト出演の問い合わせなどは以下Twitter・お便りフォームまでお願いします。 Twitter ＃サイエンマニア https://twitter.com/REN_SciEnTALK 研究者レンのもう１つの番組 SciEnTALK/サイエントークはこちら→ https://lit.link/scientalk おたよりフォーム https://forms.gle/H4vg7MuN77VqbHV79 1シーズン1人のゲスト形式で、各エピソードは一区切りのチャプターとしてご利用いただけます。 流し聞きする場合は、エピソードを古い順に並べ替えていただくとシームレスに聞くことができます。 BGM Future Sky/ SAKURA BEATZ.JP Somehow/Khaim https://www.khaimmusic.com/
海洋微生物の「ソーラーパネルと日傘」仮説【海洋微生物②】#18
熊谷さんの博士課程時代の研究内容について語っていただきました。 微生物の生存戦略、とにかく面白い！ 【ゲスト】熊谷洋平さん 株式会社tayo代表取締役 海洋微生物学の環境学博士 Twitter: https://twitter.com/kmoooooog 株式会社tayo: https://tayo.jp/recruitments/student ▶熊谷さんの研究内容 プレスリリースはこちら 光を利用するか、それとも避けるか？～海洋細菌の二種類の光適応戦略の解明～ https://www.aori.u-tokyo.ac.jp/research/news/2018/20180206.html ▶ロドプシン:脊椎動物の光受容器細胞に存在する色素 ▶早稲田大学 園池公毅 先生 http://www.photosynthesis.jp/lab.html ▶フラボバクテリウム属: グラム陰性の非運動性または運動性の桿菌。現在まで200種以上が確認されている。 ▶ピリミジンダイマー：2つのピリミジン塩基間に架橋結合が生じた二量体の呼称。DNA（またはRNA）に紫外線照射すると、同一鎖に隣接するピリミジン残基の5位および6位間に共有結合が形成される反応が進行して二量体となる。紫外線による細胞致死の主因であるされる。 ▶ジェネラリストとスペシャリスト ▶カイメン：海綿動物ともいわれる海綿動物門に属する動物の総称。熱帯の海を中心に世界中のあらゆる海に生息する。細かい網目状の海綿質繊維からなる骨格はスポンジとしても用いられる。 ▶テトロドトキシン：フグ毒として知られる毒素。ビブリオ属やシュードモナス属などの一部の真正細菌によって生産されるアルカロイド。 ▶DOM：粒径0.45μm以下の溶存態有機物Dissolved Organic Matter) ▶POM：粒径0.45μm以上の粒状態有機物(Particulate Organic Matter) ▶コンベアベルト理論とワンピース ▶アナフィラキシーショックとハンターハンター ▶SAR11：ペラジバクター目は、海洋表層中の自由生活性細菌の実に約3分の1を構成する、αプロテオバクテリア綱に含まれる目。この目に属する系統は海洋中の全原核生物細胞の25-50%を占めると推定されている。この分類群は当初メタゲノムデータによってのみ存在が知られており、SAR11グレードと名前が付けられた。 ▶ビブリオ属：グラム陰性桿菌に分類される通性嫌気性菌の一属。自然界では海水などの水中に多く存在する環境中の常在細菌であり、コレラ菌や腸炎ビブリオなどの病原体もこのグループに含まれる。 ▶TCA回路：Kreb's回路またはクエン酸回路とも呼ばれ，ミトコンドリアのマトリックスで行われる９段階からなる環状の代謝経路。解糖作用で生じたピルビン酸が，炭酸ガスと水とに分解するときの生体内反応回路。 質問、感想、ゲスト出演の問い合わせなどは以下Twitter・お便りフォームまでお願いします。 Twitter ＃サイエンマニア https://twitter.com/REN_SciEnTALK 研究者レンのもう１つの番組 SciEnTALK/サイエントークはこちら→ https://lit.link/scientalk おたよりフォーム https://forms.gle/H4vg7MuN77VqbHV79 1シーズン1人のゲスト形式で、各エピソードは一区切りのチャプターとしてご利用いただけます。 流し聞きする場合は、エピソードを古い順に並べ替えていただくとシームレスに聞くことができます。 BGM Future Sky/ SAKURA BEATZ.JP Somehow/Khaim https://www.khaimmusic.com/
海洋微生物の研究！ロドプシンとプロトンポンプ【海洋微生物①】#17
シーズン5は「海洋微生物の世界」初回は海洋微生物学の概要について語っていただきました。 【ゲスト】熊谷洋平さん 株式会社tayo代表取締役 海洋微生物学の環境学博士 Twitter: https://twitter.com/kmoooooog 株式会社tayo: https://tayo.jp/recruitments/student 自己紹介記事: https://magazine.tayo.jp/2021/07/04/%e7%86%8a%e8%b0%b7%e3%80%81%e7%a0%94%e7%a9%b6%e8%80%85%e3%82%84%e3%82%81%e3%82%8b%e3%81%a3%e3%81%a6%e3%82%88/ ▶シアノバクテリア：酸素を発生する光合成（酸素発生型光合成）を行う原核生物 ▶有光層：海洋などにおいて太陽光の届く範囲の水層のこと ▶JAMSTEC：海洋研究開発機構、文部科学省所管の国立研究開発法人。既存の調査船や潜水船などに加え、2004年の独立行政法人化の際に東京大学海洋研究所から移管された調査船を用いて、海洋、大陸棚、深海などを観測研究している。 ▶ディープフリーザー：超低温(-50~-80℃)の冷凍庫 ▶炭素循環：地球上の生物圏、岩石圏、水圏、大気圏の間で炭素が交換される生物地球化学的な循環 ▶海洋微生物学：微生物を海洋における有用生物資源の一つとして位置づけ，有用微生物の探索と単離を行い，生化学的・生理学的・生態学的特性の解析ならびに有効活用するための理論と技術について研究する学問 https://www.bio.mie-u.ac.jp/academics/master-15/dep03/course08/lab56/ ▶微生物海洋学：生物過程に着目して海洋のありかたを明らかにしようとする学問 ▶ロドプシン:脊椎動物の光受容器細胞に存在する色素、ロドプシン＝オプシン＋レチナール SciEnTALKのロドプシンの説明エピソードはこちら→ https://anchor.fm/dashboard/episode/e14sja7 ▶プロトンポンプ：生物体内で光エネルギーなどを利用して水素イオン（プロトン）を能動輸送し、生体膜の内外に膜電位やプロトン勾配を作り出す機能、またはそれを行うタンパク質複合体をいう。 ▶メタゲノム解析：「超越」を意味するメタと「ゲノム」を融合した造語。微生物群集をそのままゲノムを精製し、直接配列情報を網羅的に解析すること。 質問、感想、ゲスト出演の問い合わせなどは以下Twitter・お便りフォームまでお願いします。 Twitter ＃サイエンマニア https://twitter.com/REN_SciEnTALK SciEnTALK/サイエントークはこちらから → https://lit.link/scientalk おたよりフォーム https://forms.gle/H4vg7MuN77VqbHV79 1シーズン1人のゲスト形式で、各エピソードは一区切りのチャプターとしてご利用いただけます。 流し聞きする場合は、エピソードを古い順に並べ替えていただくとシームレスに聞くことができます。 BGM Future Sky/ SAKURA BEATZ.JP Somehow/Khaim https://www.khaimmusic.com/
生命の材料はどこに？宇宙を語るポッドキャストのこれから。【コペテンナイトコラボ 惑星大気④】#16
生命の材料はどこにあるかや、ポットキャストにおける話し手と聞き手などについて語りました。 【ゲスト】春名まこと さん 惑星科学を専攻する大学生 ▶コペテンナイト→ https://anchor.fm/1t47na66ceg 宇宙のお話をしているポットキャスト ▶ごはんのおとも→ https://anchor.fm/ucbptcpp86o 春名まことさんの日常を語るポッドキャスト ▶RNAワールド：原始地球上に存在したと仮定される、RNA からなる自己複製系のこと。また、これがかつて存在し現生生物へと進化したという仮説を RNA ワールド仮説と呼ぶ。 ▶異分野が入り乱れる宇宙 ▶生命の材料はどこにある？ ▶コペテンナイトの今後 ▶ポッドキャストにおける話し手と聞き手 質問、感想、ゲスト出演の問い合わせなどは以下Twitter・お便りフォームまでお願いします。 Twitter ＃サイエンマニア https://twitter.com/REN_SciEnTALK SciEnTALK/サイエントークはこちらから → https://lit.link/scientalk おたよりフォーム https://forms.gle/H4vg7MuN77VqbHV79 1シーズン1人のゲスト形式で、各エピソードは一区切りのチャプターとしてご利用いただけます。 流し聞きする場合は、エピソードを古い順に並べ替えていただくとシームレスに聞くことができます。 BGM Somehow/Khaim https://www.khaimmusic.com/
宇宙のロマンと「宇宙人に遭遇したらどうする？」【コペテンナイトコラボ 惑星大気③】#15
スケールの大きな宇宙のロマンと、宇宙人にもし遭遇したらどうするか？のイメトレをしました。 【ゲスト】春名まこと さん 惑星科学を専攻する大学生 ▶コペテンナイト→ https://anchor.fm/1t47na66ceg 宇宙のお話をしているポットキャスト ▶ごはんのおとも→ https://anchor.fm/ucbptcpp86o 春名まことさんの日常を語るポッドキャスト ▶ハッブル宇宙望遠鏡：1990年に打ち上げられた地上約600km上空の軌道上を周回する宇宙望遠鏡。 ▶エドウィン・ハッブル：アメリカの天文学者。天の川銀河系の外にも銀河が存在することやそれらの銀河からの光が宇宙膨張に伴って赤方偏移していることを発見した。 ▶ジェイムズ・ウェッブ宇宙望遠鏡：アメリカ航空宇宙局（NASA）が中心となって開発を行っている赤外線観測用宇宙望遠鏡。 ▶ジェイムズ・エドウィン・ウェッブ：アメリカの官僚で、第2代NASA長官。マーキュリー計画での最初の有人飛行からジェミニ計画を経て、アポロ計画による最初の有人飛行の直前までを担当した。 ▶プランク時代：宇宙論において、宇宙の歴史の最初の0秒から約10-43秒（プランク時間）の間の時間。プランク時間はおそらく時間の最小単位であり、プランク時代はこの長さであるため、時間の最初の瞬間であるとも言える。 ▶イーロンマスク：火星への移住計画を目標に掲げる米宇宙企業スペースＸの創業者。火星への有人飛行について、「生きて帰れない可能性もある」と警告している。 ▶宇宙人に遭遇したらどうする？ ▶テラフォーマーズ：火星のテラフォーミング用に放たれたことで人型へと進化したゴキブリ「テラフォーマー」と、それを駆除するために特殊な手術を施された人間との戦いを描いたSF漫画。週刊ヤングジャンプ連載中。 ▶Starlink：Space Xが開発した世界中に高速・低遅延の衛星ブロードバンドインターネットを提供するサービス。 質問、感想、ゲスト出演の問い合わせなどは以下Twitter・お便りフォームまでお願いします。 Twitter ＃サイエンマニア https://twitter.com/REN_SciEnTALK SciEnTALK/サイエントークはこちらから → https://lit.link/scientalk おたよりフォーム https://forms.gle/H4vg7MuN77VqbHV79 1シーズン1人のゲスト形式で、各エピソードは一区切りのチャプターとしてご利用いただけます。 流し聞きする場合は、エピソードを古い順に並べ替えていただくとシームレスに聞くことができます。 BGM Somehow/Khaim https://www.khaimmusic.com/